MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BLC1

Total Repeats: 43431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017216	CG	4	8	90	97	0 %	0 %	50 %	50 %	452892166
2	NC_017216	GGCT	2	8	103	110	0 %	25 %	50 %	25 %	452892166
3	NC_017216	GGT	2	6	132	137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452892166
4	NC_017216	CAC	2	6	141	146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452892166
5	NC_017216	GC	3	6	218	223	0 %	0 %	50 %	50 %	452892166
6	NC_017216	GCC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452892166
7	NC_017216	GGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452892166
8	NC_017216	GCC	2	6	349	354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452892166
9	NC_017216	GCG	3	9	430	438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452892166
10	NC_017216	CGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
11	NC_017216	GCA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
12	NC_017216	ACG	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
13	NC_017216	CAC	2	6	618	623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452892166
14	NC_017216	CGC	2	6	638	643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452892166
15	NC_017216	GTTC	2	8	659	666	0 %	50 %	25 %	25 %	452892166
16	NC_017216	CGG	2	6	828	833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452892166
17	NC_017216	CG	3	6	905	910	0 %	0 %	50 %	50 %	452892166
18	NC_017216	CGAG	2	8	923	930	25 %	0 %	50 %	25 %	452892166
19	NC_017216	ACGA	2	8	937	944	50 %	0 %	25 %	25 %	452892166
20	NC_017216	TGC	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452892166
21	NC_017216	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
22	NC_017216	CGG	2	6	1059	1064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452892166
23	NC_017216	TTC	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452892166
24	NC_017216	GCC	2	6	1149	1154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452892166
25	NC_017216	GGA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452892166
26	NC_017216	GCC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452892166
27	NC_017216	ACG	2	6	1295	1300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
28	NC_017216	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452892166
29	NC_017216	CT	3	6	1380	1385	0 %	50 %	0 %	50 %	452892166
30	NC_017216	ACC	2	6	1388	1393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452892166
31	NC_017216	CAC	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452892166
32	NC_017216	CAT	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452892166
33	NC_017216	CG	4	8	1476	1483	0 %	0 %	50 %	50 %	452892166
34	NC_017216	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
35	NC_017216	GCC	2	6	1529	1534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452892166
36	NC_017216	CG	3	6	1577	1582	0 %	0 %	50 %	50 %	452892166
37	NC_017216	CGG	2	6	1623	1628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452892166
38	NC_017216	ACCAC	2	10	1634	1643	40 %	0 %	0 %	60 %	452892166
39	NC_017216	CATG	2	8	1647	1654	25 %	25 %	25 %	25 %	452892166
40	NC_017216	AGC	2	6	1733	1738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452892166
41	NC_017216	AGC	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017216	T	6	6	1832	1837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017216	GGC	3	9	1849	1857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017216	CGG	2	6	1866	1871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017216	GAG	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017216	TG	3	6	1994	1999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017216	CGC	2	6	2003	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017216	CGG	2	6	2062	2067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017216	TGT	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017216	CA	3	6	2118	2123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017216	TAC	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017216	TCG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017216	TCA	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017216	CGG	2	6	2234	2239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017216	TTCG	2	8	2379	2386	0 %	50 %	25 %	25 %	384193074
56	NC_017216	GAC	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193074
57	NC_017216	ACGC	2	8	2420	2427	25 %	0 %	25 %	50 %	384193074
58	NC_017216	GGC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193074
59	NC_017216	CG	4	8	2511	2518	0 %	0 %	50 %	50 %	384193074
60	NC_017216	CGT	2	6	2553	2558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193074
61	NC_017216	GCT	2	6	2571	2576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193074
62	NC_017216	TGC	2	6	2594	2599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193074
63	NC_017216	GAC	2	6	2631	2636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193074
64	NC_017216	CCGGC	2	10	2651	2660	0 %	0 %	40 %	60 %	384193074
65	NC_017216	CGA	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193074
66	NC_017216	GCG	2	6	2926	2931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193074
67	NC_017216	CCGTT	2	10	2964	2973	0 %	40 %	20 %	40 %	384193074
68	NC_017216	CCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193074
69	NC_017216	TGG	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193074
70	NC_017216	AACGC	2	10	3182	3191	40 %	0 %	20 %	40 %	384193074
71	NC_017216	CGGC	2	8	3233	3240	0 %	0 %	50 %	50 %	384193074
72	NC_017216	GAC	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193074
73	NC_017216	GCA	2	6	3408	3413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193074
74	NC_017216	GAG	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193074
75	NC_017216	GCA	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017216	AGGA	2	8	3512	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017216	TCG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193075
78	NC_017216	TCG	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193075
79	NC_017216	GCC	2	6	3730	3735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193075
80	NC_017216	CG	3	6	3739	3744	0 %	0 %	50 %	50 %	384193075
81	NC_017216	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384193075
82	NC_017216	ACA	2	6	3776	3781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384193075
83	NC_017216	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193075
84	NC_017216	CGG	2	6	3858	3863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193075
85	NC_017216	TCG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193075
86	NC_017216	CGA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193075
87	NC_017216	CGTT	2	8	3961	3968	0 %	50 %	25 %	25 %	384193075
88	NC_017216	GCC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193075
89	NC_017216	CG	3	6	4045	4050	0 %	0 %	50 %	50 %	384193075
90	NC_017216	AGG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193075
91	NC_017216	GAG	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193075
92	NC_017216	GC	3	6	4102	4107	0 %	0 %	50 %	50 %	384193075
93	NC_017216	CGT	2	6	4274	4279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193075
94	NC_017216	CGA	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193075
95	NC_017216	GGC	2	6	4344	4349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193075
96	NC_017216	GAC	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193075
97	NC_017216	TCG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193075
98	NC_017216	CGCTGG	2	12	4490	4501	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384193075
99	NC_017216	TCT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384193075
100	NC_017216	GTG	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193075
101	NC_017216	CGA	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193075
102	NC_017216	CGT	2	6	4597	4602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193075
103	NC_017216	ATC	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193075
104	NC_017216	GCG	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193075
105	NC_017216	GCCCAT	2	12	4690	4701	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384193075
106	NC_017216	GGC	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193075
107	NC_017216	GGC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193075
108	NC_017216	GCCG	2	8	4773	4780	0 %	0 %	50 %	50 %	384193075
109	NC_017216	GCC	2	6	4804	4809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193075
110	NC_017216	GCAT	2	8	4835	4842	25 %	25 %	25 %	25 %	384193075
111	NC_017216	GCAG	2	8	4843	4850	25 %	0 %	50 %	25 %	384193075
112	NC_017216	GAGC	2	8	4952	4959	25 %	0 %	50 %	25 %	384193075
113	NC_017216	GCCG	2	8	5000	5007	0 %	0 %	50 %	50 %	384193076
114	NC_017216	GAG	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193076
115	NC_017216	CGA	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193076
116	NC_017216	GTT	2	6	5123	5128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384193076
117	NC_017216	CGCA	2	8	5219	5226	25 %	0 %	25 %	50 %	384193076
118	NC_017216	TGGG	2	8	5232	5239	0 %	25 %	75 %	0 %	384193076
119	NC_017216	CGT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193076
120	NC_017216	TGC	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193076
121	NC_017216	GCAA	2	8	5410	5417	50 %	0 %	25 %	25 %	384193076
122	NC_017216	GCG	2	6	5473	5478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017216	GC	3	6	5502	5507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017216	C	6	6	5521	5526	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017216	TAG	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017216	TG	3	6	5601	5606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017216	CAAC	2	8	5653	5660	50 %	0 %	0 %	50 %	384193077
128	NC_017216	CGATC	2	10	5697	5706	20 %	20 %	20 %	40 %	384193077
129	NC_017216	ACG	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
130	NC_017216	GAC	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
131	NC_017216	ACG	2	6	5780	5785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
132	NC_017216	CAC	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193077
133	NC_017216	TCG	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193077
134	NC_017216	CGA	2	6	5979	5984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
135	NC_017216	CGA	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
136	NC_017216	CGG	2	6	6063	6068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193077
137	NC_017216	CGG	4	12	6075	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193077
138	NC_017216	CGG	2	6	6099	6104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193077
139	NC_017216	GGT	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384193077
140	NC_017216	CG	3	6	6146	6151	0 %	0 %	50 %	50 %	384193077
141	NC_017216	CTA	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193077
142	NC_017216	CGA	3	9	6246	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
143	NC_017216	GAC	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
144	NC_017216	GCA	2	6	6332	6337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
145	NC_017216	CAG	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
146	NC_017216	CGA	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
147	NC_017216	GC	3	6	6409	6414	0 %	0 %	50 %	50 %	384193077
148	NC_017216	CGGCGA	2	12	6426	6437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384193077
149	NC_017216	GGA	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193077
150	NC_017216	CCA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193077
151	NC_017216	GGC	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193077
152	NC_017216	GAG	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193077
153	NC_017216	CG	3	6	6694	6699	0 %	0 %	50 %	50 %	384193077
154	NC_017216	CAAAGA	2	12	6747	6758	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384193077
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159	NC_017216	CAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193077
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161	NC_017216	GAA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384193077
162	NC_017216	CGC	2	6	7015	7020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193077
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165	NC_017216	GGC	2	6	7123	7128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193077
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167	NC_017216	CGG	3	9	7260	7268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384193077
168	NC_017216	ATC	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193077
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170	NC_017216	CGGC	2	8	7403	7410	0 %	0 %	50 %	50 %	384193077
171	NC_017216	GCC	2	6	7428	7433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193077
172	NC_017216	AAGGC	2	10	7511	7520	40 %	0 %	40 %	20 %	384193077
173	NC_017216	ACC	2	6	7603	7608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193077
174	NC_017216	ACC	2	6	7619	7624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193077
175	NC_017216	CGA	2	6	7665	7670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
176	NC_017216	CGA	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193077
177	NC_017216	CCG	2	6	7707	7712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193077
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179	NC_017216	GCC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_017216	GT	3	6	7792	7797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017216	AACC	2	8	7840	7847	50 %	0 %	0 %	50 %	384193078
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191	NC_017216	ACA	2	6	8143	8148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384193078
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247	NC_017216	CAT	2	6	9959	9964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193078
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250	NC_017216	GCC	2	6	10030	10035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193078
251	NC_017216	CCG	2	6	10039	10044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384193078
252	NC_017216	CG	3	6	10065	10070	0 %	0 %	50 %	50 %	384193078
253	NC_017216	CGA	2	6	10073	10078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193078
254	NC_017216	GATG	2	8	10088	10095	25 %	25 %	50 %	0 %	384193078
255	NC_017216	TCG	2	6	10126	10131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193078
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257	NC_017216	TCG	2	6	10240	10245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193078
258	NC_017216	GTC	2	6	10251	10256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193078
259	NC_017216	CAC	2	6	10343	10348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384193078
260	NC_017216	CGA	2	6	10382	10387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384193078
261	NC_017216	ATC	2	6	10389	10394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384193078
262	NC_017216	CGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384193078
263	NC_017216	GAT	2	6	10532	10537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384193078
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265	NC_017216	GAG	2	6	10847	10852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384193079
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267	NC_017216	AAG	2	6	10883	10888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384193079
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